断对断奶仔猪腹泻的鉴别诊断包括沙门菌病、猪痢疾和猪增生性肠病。其他能引起腹泻的病毒、细菌及寄生虫病还有轮状和冠状病毒性肠炎、断奶后大肠杆菌病、鞭虫病和球虫病。目前沙门菌病常与其他病共发。