沙门菌在环境中的广泛分布使得此病的诊断无法依赖于病原分离。分离到细菌并具有相应的病变，才能诊断为沙门菌病。回肠和回盲肠淋巴结的混合样本应足以诊断出正在发病的或新近康复的病例，其他组织如扁桃体或盲肠壁也常常可分离出细菌。