引起猪流感的病原体是一种分节段的RNA病毒，属于正黏病毒科、A型流感病毒属。A型流感病毒（在我国又被称为甲型流感病毒）是猪、禽及人的病原，对盐酸金刚烷胺敏感。致使猪发生流感的A型流感病毒至少有H1N1、H3N2、H1N2、H4N6、H1N7、H3N6和H9N27种不同血清亚型。近些年来，有禽流感病毒H5N1引起猪感染的报道。